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抗體革命迫在眉睫

更新時間:2015-12-14 點擊量:846

一只小鼠提醒了Clifford Saper這樣一個事實:抗體正在誤導科學界。在1994年到2011年間,Clifford Saper擔任《比較神經(jīng)學》(Comparative Neurology)雜志的主編。在此期間,他看到了一大堆依靠抗體來標記神經(jīng)遞質(zhì)及其受體位置的論文。2000年前后,基因敲除小鼠在生物領域大受歡迎,但結(jié)果令人不安。按道理說,基因敲除動物的染色結(jié)果應該和對照組小鼠的染色結(jié)果存在很大差別。但很多時候結(jié)果相同。據(jù)如今是波士頓貝絲·以色列·迪肯尼斯醫(yī)療中心(Beth Israel Deaconess Medical Center,BIDMC)神經(jīng)部門主席的Saper回憶,他們發(fā)現(xiàn)越來越多的論文因此被撤稿。同時Saper也意識到,他們?nèi)狈ο到y(tǒng)的方法來評估這些使用抗體的論文。

于是單個雜志革命開始了。Saper和編輯部的同事們提出了一條規(guī)則,要求作者提供論文中使用的抗體的廣泛驗證數(shù)據(jù)。據(jù)Saper回憶,這條政策對文章的嚴謹性有很大好處,但對于論文的投稿不利。“很多作者會覺得麻煩,會選擇投稿到其它雜志。”但Saper堅持這一原則。他的努力zui終形成了JCN抗體數(shù)據(jù)庫,一個包含幾千個可信賴的神經(jīng)解剖學抗體的清單。

如今,醫(yī)學研究者仍然不斷遭遇抗體悲劇。zui常見的悲劇是騙人的抗體:購買的用于檢測蛋白X的抗體優(yōu)先與蛋白Y結(jié)合(甚至可能*不與X結(jié)合)。另一個悲劇是可重復性差:用新抗體重復以前的實驗,發(fā)現(xiàn)結(jié)果無法重復。一個好項目因此擱淺(見文末:處于困境的抗體市場)。

但技術的進步和科學界的需求變化將會終結(jié)這個抗體泥潭。

抗體是生命科學領域zui常用的工具之一。zui普遍的用法是在 Western blot中揭示細胞或組織樣本中特定蛋白質(zhì)的表達量的多少。此外,它們也被用于免疫組化和免疫熒光染色,以便于在顯微鏡下可視化地觀察蛋白,以及其它各類基于抗體會與特定生物分子結(jié)合的實驗。據(jù)網(wǎng)上生物試劑商城Biocompare 2015年發(fā)表的一份報告估計,科研用抗體市場規(guī)模達到25億美金,并且仍在增長??贵w的選擇也讓人眼花繚亂——有數(shù)以百計的抗體供應商。

在這一巨大市場的背景下,抗體的不可靠性問題非常讓人警醒。特異性不足、敏感度和批次差異性等導致了錯誤的科研發(fā)現(xiàn)和大量的科研精力浪費??贵w的不可靠性造成了癌癥、代謝、老化、免疫學和細胞信號轉(zhuǎn)導以及任何研究復雜的生物分子的領域的巨大損失。因抗體而造成的、在時間和資源方面的浪費非常巨大。據(jù)估計,每年因購買質(zhì)量差的抗體導致的損失達到8億美金,更不要說所造成的無數(shù)的錯誤結(jié)論、不可解釋的(或曲解)實驗,以及浪費了的病人樣本和增加了的徒勞的研究時間。

瑞典*理工學院(Royal Institute of Technology)的研究員Mathias Uhlén表示,因抗體而造成的挫敗已經(jīng)太多了,是時候做出改進了。“學界對解決這個問題懷有很大興趣。”